• 大數據和算法助推基因檢測對抗腫瘤

    時間:2019-01-04 22:46:20 來源: 北國網

    至本醫療科技(上海)有限公司(以下簡稱:至本醫療科技)創建于2016年,是一家專注于幾百個癌癥基因全面檢測和基因數據庫的創新公司,擁有中國人群NTRK融合分布的NGS數據,同時擁有NGS的融合檢測專利技術(OriFusion)。

    簡單來說,幾乎所有抗癌新藥的研制都基于基因檢測大數據。而現在的趨勢是,癌癥療法的演變正從“基于癌癥在體內的起源部位”轉向“基于癌癥的分子特征”。腫瘤治療不再局限于腫瘤類型,二是根據NTRK基因靶向來指導用藥。至本醫療科技有望為這一進程提供基礎性數據和治療信息。

    越精準越細分

    作為全球腫瘤精準治療走在前列的國家,美國在加大力度支持精準治療和基因新藥的研發。

    2017年年底,美國食品藥品管理局(FDA)分別通過了斯隆-凱特林癌癥研究中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center,簡稱MSK)和FMI兩家機構的基于二代測序NGS的大panel包括幾百個癌癥基因變異檢測分析平臺。其中,MSK的基因檢測平臺MSK-IMPACT,它能夠對468個基因的基因突變及遺傳變異進行快速靈敏的檢測;FMI的基因檢測平臺FoundationOne CDx(F1CDx)包含315個基因和基因組特征的變異檢測。

    2018年3月16日,美國醫療保險與醫療服務中心(CMS)發布最新方案,全美的晚期癌癥(即復發性、轉移性、難治性III或IV期癌癥等)患者的大panel癌癥基因檢測將實現覆蓋醫保,F1CDx被列入CMS最終方案,并將美國全國性醫保調整為覆蓋所有實體瘤。CMS同時表示,這種大panel癌癥基因檢測涵蓋診斷性實驗室檢測(LDT)。

    為了推動中國腫瘤精準治療行業與國際同行保持同步發展節奏,中國相關部門也在積極制訂一系列政策文件,指導和推動行業發展。今年8月,中國國家藥品監督管理局(NMPA)批準美國Illumina公司的基因測序儀MiSeqDx在中國上市,這對整個中國基因檢測行業來說,具有深遠的意義。

    誰將決勝未來?

    新的競爭環境中,中國藥企如何在新的起跑線上不落后于國際競爭對手?最關鍵是要掌握核心的基因檢測數據。在腫瘤基因新藥研發過程中,誰掌握的數據資源多,誰就具備了新藥研發的先發競爭優勢。而為了推動中國制藥企業在腫瘤基因新藥領域的研發,必須大力發展基因檢測行業,只有站在整個產業鏈角度去思考,才能保證中國整個腫瘤醫療行業能在新的賽道中保持國際競爭力。

    中國在生物信息算法領域有優勢的科技企業也成為發力點。它們正在吸引國際專家加盟共建。比如全球癌癥基因組學專家Matthew Meyerson教授就正式加入至本醫療科技擔任科學顧問委員會主席。Matthew Meyerson教授在2014年被湯森路透社評為“全球最有影響力的科學家”之一,同時,他也是美國基礎醫學公司(Foundation Medicine,簡稱FMI)創始人,現任全球最著名的基因組研究中心(Broad Institute, 哈佛大學和MIT合辦)主任,管理著十余位諾貝爾獎獲得者。

    Matthew Meyerson教授看好的未來趨勢正在變成現實,腫瘤治療不再局限于腫瘤類型,而是根據NTRK基因靶向來指導用藥。但先決條件是,患者必須攜帶有NTRK基因融合。NTRK基因融合是最近發現的癌癥治療的靶點,它在常見腫瘤中發生率通常<1%。想要知道是否有NTRK融合突變,就需要做基因檢測。通常的基因檢測并不會包含有NTRK基因,也就是并不能常規的提供患者是否有NTRK融合變異的信息。

    這對于至本醫療科技是一個利好消息。至本醫療科技核心產品設計之初均包含NTRK融合檢測。2017年9月,至本醫療科技推出首個也是目前唯一一個為融合檢測而定制的產品“元溯S”(包含RNA和DNA的共同檢測)。

    早在2017前,至本醫療科技就已經在檢測這個靶點基因。根據至本醫療科技首次發布的中國實體瘤患者NTRK融合圖譜顯示,在5千多例臨床病例中,通過NGS檢測,共有22例(0.4%)患者攜帶NTRK融合。其中,在中國患者群體中,NTRK融合在纖維肉瘤和結直腸癌中的發生率相對較高(分別為11.1%和1%)。而西方人群中11502例實體瘤中0.27%報告有NTRK基因融合。

    “隨著基因檢測技術越來越精準,癌癥精準治療將越來越細分,不同的突變可以使用不同的精準藥物,真正實現個體化治療?!?至本醫療科技首席運營官(COO)秦瑩說。

    而未來,也將有越來越多藥物將依賴于基因檢測的準確性。藥物上市的證據取決于變異檢測和臨床數據的整合和統計,從而極大加快藥物上市審批速度。這正在慢慢革新傳統藥企的戰略和布局。

    同時,至本醫療科技基因檢測形成的全面、準確、高質量的數據庫,將成為其未來通往千億腫瘤新藥研發市場的法寶。

    “中國擁有全球最大的腫瘤患者人群,這意味著,至本醫療獲得的數據量也將是驚人的。據公開數據顯示,目前,中國腫瘤病患存量市場規模已經達到1000萬,并且每年新發的病患數量已達到400多萬人。這意味著,高質量、全面準確的數據庫對于腫瘤精準治療的未來發展尤為重要。中國的腫瘤患病人群已經是全世界患病人群最多的,無論從新發,還是從存量腫瘤患者,是全世界最大的患病群體,中國腫瘤病患人群又有很多獨特的特點?!鼻噩撜f。

    對于基因檢測公司來說,未來誰掌握了核心的生物分析算法技術和大數據資源,就將在未來腫瘤治療新藥研制市場掌握主導權。(文/李小華)

    編輯:熊雪華

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